Rīgas Tehniskā universitāte (RTU), kas ir lielākā un vecākā inženierzinātņu augstskola Latvijā, šajā izvērtējumā nav iekļuvusi pat 15 izcilnieku skaitā, kas bijis pārsteigums pašai augstskolai. RTU skaidro, ka izvērtējumā zemāku vērtējumu saņēmuši institūti, kuriem ir ļoti daudz publikāciju citējamās datubāzēs, augsta doktorantu aizstāvēšanas efektivitāte, nekā institūtiem, kuriem šo publikāciju nav.
RTU ir 42 zinātniskie institūti, daudzi saņēmuši vien apmierinošu vērtējumu – divus punktus, bet seši novērtēti kā vāji – ar vienu punktu. Kā uzsver augstskolā, ja novērtējums notiktu tagad, aina būtu citādāka, jo jau gadu institūtu skaits ir samazināts. Pašlaik visi institūti ir apvienoti faktiski vienā zinātniskajā institūtā, kas ir RTU un viena aģentūra.
Arī Latvijas Lauksaimniecības universitāte (LLU) uzskata, ka vērtēšanas kritēriji nav bijuši objektīvi, kuras institūti novērtēti ar diviem un vienu punktu. LLU domā par institūtu apvienošanu, taču uzsver – diez vai tas uzlabos kopējo situāciju zinātnē, kur kā atzīst paši vērtētāji, valsts atvēl dramatiski mazu finansējumu.
Kādreizējais izglītības ministrs Roberts Ķīlis telefonintervijā Panorāmā sacīja, ka izvērtējuma kritēriji bijuši publiski pieejami un šāda metadoloģija ir izmantota vairāk nekā 10 valstīs. Ķīlis arī teica, ka cilvēki, kas veica izvērtējumu, ir ārkārtīgi augstas raudzes speciālisti. Viņš arī piebilst, ka lielā mērā tas ir bijis atkarīgs no pašiem institūtiem – kā sevi piedāvāt, jo bijis jāsniedz arī pašvērtējums.
Diena.lv jau vēstīja, ka Latvijas zinātnisko institūciju starptautiskajā izvērtējumā 22 institūti un augstskolu struktūrvienības ieguvušas vāju vērtējumu, un eksperti iesaka tās slēgt. Šo institūtu sarakstu solīts publiskot piektdien.