Iepriekš tika ziņots par 21 bojāgājušo.
Pārplūdušo upju ūdeņi Kjusju salā izskalojuši ceļus un sagrāvuši ēkas un tiltus.
Meteorologi prognozē, ka lietusgāzes Japānas dienvidos tuvākajā laikā turpināsies.
Tūkstošiem cilvēku evakuēti uz patversmēm, kas iekārtotas skolu sportu zālēs un sabiedriskajās celtnēs, bet vēl apmēram 150 cilvēki joprojām ir nošķirti no ārpasaules.
Valdība glābšanas operācijā nosūtījusi 12 000 policistu, karavīru, ugunsdzēsēju un krasta apsardzes darbinieku.
Japānas premjerministrs Sindzo Abe pārtraucis vizīti Eiropā, kuras laikā otrdien viņam bija paredzēts apmeklēt Igauniju, un devies uz dzimteni, lai trešdien apmeklētu plūdu skartās vietas.